區(qū)別在于，生產(chǎn)規(guī)模和銷售收入不同、計稅辦法不同、所用的發(fā)票種類不同。一般納稅人要同時達到銷售額符合標準和會計核算健全這兩個條件，小規(guī)模納稅人無需受此限制。
生產(chǎn)規(guī)模和銷售收入不：工業(yè)、修理、修配行業(yè)年收入在50萬元以下的，商業(yè)年收入在80萬元以下的為小規(guī)模納稅人；年收入在標準之上且財務核算健全，有固定經(jīng)營場所，有專職具備會計資格的財務人員的為一般納稅人。
計稅辦法不同：即計算繳納增值稅的方法不同。小規(guī)模納稅人應繳納的稅款為全部銷售收入乘以征收率（3%）；一般納稅人應繳納的稅款為全部銷售收入乘以適用稅率（17％或13％）減外購貨物所支付的進項稅額之間的差額。
所用的發(fā)票種類不同：小規(guī)模納稅人只能領購普通發(fā)票，不能領購增值稅專用發(fā)票，如果需要開具增值稅專用發(fā)票，只能到稅務機關按其適用的征收率（3%）換開；一般納稅人可以申請領購和使用增值稅專用發(fā)票。
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