雖然銀行承兌匯票和商業(yè)承兌匯票都屬于商業(yè)匯票，但兩者的區(qū)別很大，其主要的差別，是銀行承兌匯票的保兌付，使得銀行承兌匯票的兌付風險基本為零；而商業(yè)承兌匯票的風險很高，且信用等級相對較低。這也是收款方不愿意接受商業(yè)承兌匯票的主要原因。
1.商業(yè)匯票的簽發(fā)人不同。銀行承兌匯票是由出票銀行簽發(fā)的；商業(yè)承兌匯票是由出票人簽發(fā)的，可以是收款人簽發(fā)，也可以是付款人簽發(fā)。
2.商業(yè)匯票的承兌主體不同。銀行承兌匯票由銀行負責兌付，也就是當銀行承兌匯票到期和提前貼現時，由銀行承兌；而商業(yè)承兌匯票由付款人承兌，也就是由購貨方向銷貨方支付票款。
3.商業(yè)匯票不同的承兌人，決定了不同的信用等級。銀行承兌匯票是銀行信用，由銀行承擔匯票的兌付責任，其信用等級相對較高；而商業(yè)承兌匯票是商業(yè)信用，是企業(yè)之間單純的商業(yè)交易行為而建立的商業(yè)信用。在現實交易中，接收票據的一方更愿意選擇銀行承兌匯票，畢竟銀行信用好于商業(yè)信用。
4.風險不同。銀行承兌匯票的保兌，決定了銀行承兌匯票基本上是零風險，而且在支付貼現費用的同時，可以向銀行申請貼現提前取得資金。而商業(yè)承兌匯票如果出現承兌人沒有資金支付兌付商業(yè)承兌匯票時，收款方就會存在無法收到貨款的風險，而蒙受損失，商業(yè)承兌匯票的風險相對較高，對收款人不利。
5.流通性不同。銀行承兌匯票的流通性相對較強，可以通過背書的方式進行轉讓，而且收款方愿意接受，畢竟比不能收到貨款要好很多；而商業(yè)承兌匯票的流通性明顯低于銀行承兌匯票，收款方普遍不愿意接受商業(yè)承兌匯票。
6.商業(yè)匯票到期時的處理方式不同。銀行承兌匯票到期時，如果購貨企業(yè)不能足額支付票款，承兌銀行會按照銀行承兌匯票的承兌協(xié)議，對付款方按逾期借款處理，并加收罰息。那么對于收款方（持票人）來講可以按期收回貨款。
而商業(yè)承兌匯票到期時，如果付款方沒有資金支付到期的票款，銀行不負責付款，也就是銀行沒有兌付責任，由購銷雙方自行處理。對于收款方來講存在無法按期收回貨款的風險。
7.商業(yè)匯票的貼現利率不同。現實中，商業(yè)承兌匯票的貼現率一般要高于銀行承兌匯票的貼現率，但一般不會超過同期銀行貸款利率的水平。
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