為了避免發(fā)生丟失、被盜、空頭等情況，防止由于管理不善而給單位帶來經(jīng)濟損失，各單位應(yīng)建立健全支票結(jié)算的內(nèi)部控制制度，加強對支票結(jié)算的管理和控制，具體包括：
（1）支票的管理由財務(wù)部門負責，指定的出納員專門負責，妥善保管，嚴防丟失、被盜。
（2）支票和預(yù)留銀行印鑒、支票密碼單應(yīng)分別存放，專人保管。
（3）有關(guān)部門和人員領(lǐng)用支票一般必須填制專門的“支票領(lǐng)用單”，說明領(lǐng)用支票的用途、日期、金額，由經(jīng)辦人員簽章，經(jīng)有關(guān)領(lǐng)導批準。
（4）支票由指定的出納員專人簽發(fā)；出納員根據(jù)經(jīng)領(lǐng)導批準的“支票領(lǐng)用單”按照規(guī)定要求簽發(fā)支票，并在支票簽發(fā)登記簿上加以登記。
（5）各單位不準攜帶蓋好印鑒的空白支票外出采購。如果采購金額事先難以確定，實際情況又需用空白轉(zhuǎn)賬支票結(jié)算時，經(jīng)單位領(lǐng)導同意后，出納員可簽發(fā)具有下列內(nèi)容的空白支票：定時（填寫好支票日期）、定點（填寫好收款單位）、定用途（填寫好支票用途）、限金額（在支票的右上角再加注“限額××元”宇樣）。各單位簽發(fā)空白支票要設(shè)置“空白支票簽發(fā)登記簿”，實行空白支票領(lǐng)用銷號制度，以嚴格控制空白支票的簽發(fā)。“空白支票簽發(fā)登記簿”一般應(yīng)包括以下內(nèi)容：領(lǐng)用日期、支票號碼、領(lǐng)用人、用途、收款單位、限額、批準人、銷號。領(lǐng)用人領(lǐng)用支票時要在登記簿“領(lǐng)用人”欄簽名或蓋章；領(lǐng)用人將支票的存根或未使用的：支票交回時，應(yīng)在登記簿“銷號”欄銷號并注明銷號日期。
（6）建立、健全支票報賬制度。單位內(nèi)部領(lǐng)用支票的有關(guān)部門和人員應(yīng)按規(guī)定及時報賬，遇有特殊情況與單位財務(wù)部門及時取得聯(lián)系，以便財務(wù)部門能掌握支票的使用情況，合理地安排使用資金。
（7）為避免簽發(fā)空頭支票，各單位財務(wù)部門要定期與開戶銀行核對往來賬，了解未達賬項情況，準確掌握和控制其銀行存款余額，從而為合理地安排生產(chǎn)經(jīng)營等各項業(yè)務(wù)提供決策信息。
（8）為避免收受空頭支票和無效支票，各單位應(yīng)建立收受支票的審查制度。為防止發(fā)生詐騙和冒領(lǐng)，收款單位一般應(yīng)規(guī)定必須收到支票幾天（如三天、五天）后才能發(fā)貨，以便有足夠的時間將收受的支票提交銀行，辦妥收賬手續(xù)。遇例假日相應(yīng)推后發(fā)貨時間，以防不法分子利用假日銀行休息無法辦妥收賬手續(xù)進行詐騙。
（9）一旦發(fā)生支票遺失，立即向銀行辦理掛失或者請求銀行和收款單位協(xié)助防范。