出納核算方法主要包括設(shè)置賬戶、復式記賬、審核和填制憑證、登記賬簿、財產(chǎn)清查、編制報表，以及對出納核算資料進行分析和利用等方法。
（1）設(shè)置賬戶。
設(shè)置賬戶是對核算對象的具體內(nèi)容進行分類反映和監(jiān)督的一種專門方法。就出納核算而言，要按現(xiàn)金、每一種銀行存款、每一種有價證券設(shè)置賬戶進行記錄和核算。出納工作常設(shè)賬戶有：“現(xiàn)金日記賬”、“銀行存款日記賬——結(jié)算戶存款”、“銀行存款日記賬——××專戶存款”、“長期股權(quán)投資——股票投資（××股票）”等。
（2）復式記賬。
復式記賬是對每一項經(jīng)濟業(yè)務通過兩個或兩個以上有關(guān)賬戶相互聯(lián)系起來進行登記的一種專門方法。在我國，幾十年來“增減記賬法”、“收付記賬法”、“借貸記賬法”三種復式記賬方法同時應用。但隨著新的預算會計制度的出臺，各企事業(yè)單位和行政單位統(tǒng)一使用“借貸記賬法”記賬。所以，目前企業(yè)出納記賬應當采用借貸復式記賬的方法。
（3）審核與填制憑證。
審核并填制憑證，是為了保證會計核算質(zhì)量，審查經(jīng)濟活動的合理牲、合法性而采用的一種專門方法。出納人員對經(jīng)濟業(yè)務進行賬務處理，在過賬前，也要復核有關(guān)原始憑證，填制或復核記賬憑證。原始憑證是經(jīng)濟業(yè)務的書面證明，是記賬的依據(jù)，對記錄每一經(jīng)濟業(yè)務的原始憑證進行嚴格的審核，并根據(jù)經(jīng)審核后的原始憑還填制記賬憑證，然后再據(jù)以記賬，可以保證核算質(zhì)量，明確經(jīng)濟責任。出納人員對原始憑證的復核與專管費用報銷人員對原始憑證的審核是兩個不同的過程，出納人員的復核是一種復查性的，是保證會計核算質(zhì)量的重要的和必不可少的一種手段，是出納工作的一個步驟，而費用報銷的審核則是一項專門的財務管理工作；出納人員不得兼管費用報銷等審核工作。
（4）登記賬簿。
登記賬簿是根據(jù)記賬憑證，在賬簿上連續(xù)、系統(tǒng)、全面地記錄經(jīng)濟業(yè)務的一種專門方法。按照記賬的正規(guī)方法和程序登記賬簿，并定期進行對賬、結(jié)賬，可以提供完整的、系統(tǒng)的核算資料。出納日記賬要逐筆序時進行登記，定期結(jié)出借貸發(fā)生額與余額，出具出細報告單與總賬會計進行核對。其中現(xiàn)金日記賬還要每日結(jié)出余額，并與庫存現(xiàn)金核對。
（5）財產(chǎn)清查。
財產(chǎn)清查是對各項資產(chǎn)物資進行實物盤點，賬面核對以及對各項往來款項進行查詢、核對，以保證賬賬、賬實相符的一種專門方法。通過財產(chǎn)清查，可以查明各項資產(chǎn)物資、債權(quán)債務、所有者權(quán)益等情況，加強物資管理，保持賬記與實存的一致性，并為編制報表提供可靠的資料。出納要每天清點核對庫存現(xiàn)金，經(jīng)常性地與銀行進行賬目核對，適時清點核對庫存各種有價證券和結(jié)算票據(jù)。
（6）編制會計報表。
編制會計報表是以表格形式，定期總括地反映經(jīng)濟活動和財務收支情況的一種專門方法。編制會計報表，可以反映企業(yè)財務狀況、經(jīng)營成果和預算、計劃的執(zhí)行情況，為企業(yè)增產(chǎn)節(jié)約、提高經(jīng)濟效益提供可靠的資料；為有關(guān)政府部門進行宏觀調(diào)控提供有關(guān)信息；為投資人、債權(quán)人進行投資決策提供所需資料。出納部門主要是報告本單位現(xiàn)金收支與結(jié)存情況，現(xiàn)金收支計劃的實現(xiàn)情況，資金利用情況，資金使用效益等情況。
（7）會計分析。
對核算資料進行分析利用，是對核算資料所反映的各項經(jīng)濟指標進行對比分析，以便挖掘收入潛力，找出降低成本辦法，擴大經(jīng)營成果。