各單位所需固定資產(chǎn)，除了外購之外，還可以充分利用自有人力、物力自行建造，即稱之為在建工程。在《企業(yè)會計制度》中為此專門設(shè)置了“在建工程”會計科目進行核算，工程支出發(fā)生時，借記“在建工程”科目，貸記“銀行存款”等科目；工程完工交付使用時，按實際工程支出借記“固定資產(chǎn)”科目，貸記“在建工程”科目。而在《事業(yè)單位會計制度》中未設(shè)置相應(yīng)的會計科目，進行基建業(yè)務(wù)的核算。
　　事業(yè)單位基建會計核算游離于本單位會計核算體系之外：先由建設(shè)單位完成基本建設(shè)業(yè)務(wù)，項目竣工決算后再移交給使用單位。另設(shè)基建會計賬戶進行反映，這種分離的核算方式會導致一系列問題：
　　1.在單位核算體系之外，另設(shè)一套基建賬并出具相應(yīng)的財務(wù)報告，既增加了核算工作量，又使單位無法形成一套完整的核算體系，影響了會計信息的完整性。
　　2.由于《事業(yè)單位會計制度》對基本建設(shè)業(yè)務(wù)核算沒有一個明確的規(guī)范，使其核算處于無章可循、無法可依的狀態(tài)，一些單位乘機把一些超預(yù)算、違反財經(jīng)法規(guī)的支出，也在基建賬戶中列支；把一些收入存入基建賬戶，設(shè)立“小金庫”逃避納稅等。
　　為了加強事業(yè)單位基建業(yè)務(wù)的核算與管理，可以參照《企業(yè)會計制度》設(shè)置“在建工程”科目，核算外購需要安裝的工程、基建工程、技術(shù)改造工程等發(fā)生的實際支出，待工程完工后再結(jié)轉(zhuǎn)“固定資產(chǎn)”科目，這既能滿足事業(yè)單位的實際需要，又能保證事業(yè)單位會計核算體系的完整性。
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